Relatório analítico · LC-QTOF-MS

Perfil metabólico de quatro variedades de tomate

Extração dos picos de espectrometria de massas de alta resolução em três faixas de m/z: abaixo de 100 (ácidos orgânicos, com identificação), de 100 a 500 (o grosso dos metabólitos) e acima de 1000 (região de lipídios e glicoalcaloides).

4
variedades de tomate
(Italiano, Tavares, ExtraPlus, TopSeed)
3
faixas de m/z analisadas
(<100 · 100–500 · 1000–1205)
1.482
picos catalogados
nas três faixas (neg + pos)
28
compostos nomeados
na faixa < 100 (por massa exata)

Cada variedade foi medida em ionização negativa e positiva, mais um branco (solvente/coluna) usado como controle. Em todas as faixas, o Tomate Tavares aparece com o sinal mais intenso. Abaixo, o detalhe da faixa < 100 (picos por amostra).

VariedadeCódigoPicos (neg)Picos (pos)
Tomate ItalianoITA113120
Tomate TavaresTAV120120
Tomate ExtraPlusTEP109120
Tomate TopSeedTOP95120

Método

Do arquivo bruto do equipamento à lista de compostos, por código

Um programa percorre o espectro completo de cada amostra, detecta os picos abaixo de m/z 100, refina a massa de cada um por centroide ponderado e subtrai o branco, isolando o sinal atribuível ao tomate.

Na faixa abaixo de m/z 100, cada pico recebe uma fórmula por massa exata: o programa enumera as composições químicas possíveis (C, H, N, O, P, S, Cl) dentro da tolerância do equipamento, filtra pelas regras de valência e cruza com uma base curada de metabólitos pequenos. O erro em ppm mede a confiança. Já nas faixas 100–500 e acima de 1000, entregamos a lista de picos por intensidade, mas sem nomear: nessas massas cada valor admite muitas fórmulas e isômeros, e a identificação por nome exige banco de dados (HMDB) ou MS/MS — é exatamente onde os softwares padrão (MZmine / MS-DIAL) entram.

Faixa 1 m/z abaixo de 100 — ácidos orgânicos (identificados)

Comparação entre variedades

Qual tomate é mais rico em ácidos orgânicos?

Somando a intensidade dos dez principais ácidos orgânicos (modo negativo, já sem o branco), o Tomate Tavares lidera com folga: cerca de 1,9× o Italiano, o de menor sinal. Leitura semi-quantitativa (ver ressalvas).

Soma da intensidade dos ácidos orgânicos, por variedade
unidades arbitrárias · modo negativo

Perfil de ácidos orgânicos

Intensidade de cada ácido, nas quatro variedades

Detalhe composto a composto. O Tavares aparece mais alto na maioria, com destaque para piruvato, crotonato, acetato e oxalato. Alguns picos (angelato/tiglato, acrilato) são parecidos entre as variedades.

Intensidade líquida por composto
unidades arbitrárias · modo negativo

Compostos identificados

Anotação por massa exata (modo negativo)

Identificação forte = erro de massa abaixo de 5 ppm. Os íons de matriz (fosfato, cloreto, bicarbonato) vêm do preparo/coluna, não do fruto, e estão separados abaixo.

m/zFórmulaComposto (hipótese)ErroConfiança
?

O pico mais intenso de todo o modo negativo, em m/z 94,0298 (fórmula C₅H₄NO⁻, erro −0,4 ppm), ainda não foi identificado. A fórmula é sólida; o nome do composto exige uma etapa extra (MS/MS ou cruzamento com base externa). É o candidato número um para aprofundar, caso interesse.

Modo positivo

Principalmente fragmentos, menos específico

Na faixa abaixo de m/z 100, a ionização positiva é dominada por fragmentos genéricos (acílios, carbocátions) que aparecem em muitas moléculas e não apontam um composto único. Os sinais mais interpretáveis são os íons imônio, marcadores de aminoácidos. O Tavares novamente puxa as intensidades para cima.

m/zFórmulaAtribuiçãoErro
70.0660C₄H₈N⁺Imônio de prolina (marcador de aminoácido)+12.5
84.0815C₅H₁₀N⁺Imônio de lisina / leucina+8.6
43.0179C₂H₃O⁺Acílio (fragmento acetil)+1.4
55.0179C₃H₃O⁺Fragmento acílico+1.1
57.0335C₃H₅O⁺Acílio (fragmento)+0.2
69.0699C₅H₉⁺Carbocátion (fragmento)+0.3
71.0491C₄H₇O⁺Fragmento oxigenado−0.6
Faixa 2 m/z 100 a 500 — região central dos metabólitos

Faixa m/z 100–500

A região mais rica: 841 picos catalogados

Aqui está o grosso dos metabólitos do tomate: ácidos maiores, aminoácidos, açúcares e compostos fenólicos. Foram catalogados 488 picos no modo negativo e 353 no positivo. Nesta faixa os picos não foram nomeados (exige banco de dados ou MS/MS), mas alguns já batem com metabólitos conhecidos, como m/z 191,019 = citrato, ácido clássico do tomate, forte no Tavares.

Soma da intensidade de todos os picos, por variedade
u.a. · negativo + positivo

Os picos mais intensos da faixa (as duas polaridades juntas). Célula destacada = variedade de maior sinal na linha.

m/zModoItalianoTavaresExtraPlusTopSeed
Faixa 3 m/z acima de 1000 — lipídios e glicoalcaloides

Faixa m/z 1000–1205

Moléculas grandes: 449 picos catalogados

O equipamento coletou até cerca de m/z 1205, então "acima de 1000" cobre a faixa 1000–1205 — a região de lipídios e glicoalcaloides (o tomate é rico em tomatina, por exemplo). Foram catalogados 203 picos no negativo e 246 no positivo, também sem nomeação. Aqui o TopSeed empata com o Tavares no topo, e vários picos são específicos de uma ou outra variedade.

Soma da intensidade de todos os picos, por variedade
u.a. · negativo + positivo

Picos mais intensos da faixa (quase todos em modo positivo). Célula destacada = variedade de maior sinal na linha.

m/zModoItalianoTavaresExtraPlusTopSeed

Como ler estes resultados

Quatro ressalvas honestas

01 Nome é hipótese, fórmula é fato

Abaixo de m/z 100, boa parte do sinal são fragmentos de moléculas maiores gerados no próprio equipamento. A fórmula por massa exata é robusta; o nome do composto só se confirma com MS/MS.

02 Comparação semi-quantitativa

As intensidades não estão normalizadas entre corridas. Servem para diferenças grandes (perfil, presença/ausência), não para quantificação fina de "quanto a mais" um tomate tem.

03 Sem réplicas

Cada variedade foi medida uma vez. Isso impede teste estatístico de significância. Para um estudo formal, seriam necessárias réplicas biológicas.

04 Reprodutível e auditável

Todo o processo é código versionado: mesma entrada gera a mesma saída, com os parâmetros documentados. Pode ser conferido contra o software padrão da área (MS-DIAL / MZmine).

Próximos passos possíveis

Se o objetivo for aprofundar
  • Nomear os picos das faixas 100–500 e 1000–1205 cruzando com banco (HMDB / MassBank) ou MS/MS — é o maior salto de valor agora.
  • Identificar o pico dominante m/z 94,0298 da faixa < 100.
  • Normalizar as intensidades entre corridas para permitir comparação quantitativa entre as variedades.
  • Rodar réplicas para dar suporte estatístico às diferenças observadas.
  • Conferência cruzada no MS-DIAL/MZmine, caso o resultado precise de peso pericial/formal.